AG Galardini
Projekte
Prüfung der Auswirkungen des genetischen Hintergrunds auf die antimikrobielle Resistenz
Populationsgenetische Studien zeigen, dass genetische Variabilität zwischen Bakterienstämmen die Entwicklung antimikrobieller Resistenzen beeinflussen kann. Durch den Einsatz der automatisierten Laborevolution (ALE) untersuchen wir, wie genetische Hintergründe die AMR-Evolution steuern.
Untersuchungen von Genotyp zu Phänotyp bei Bakterien
Durch die Anwendung statistischer Genetikmethoden auf Erregergenomsequenzen wollen wir genetische Determinanten von Phänotypen wie Pathogenität, Virulenz und Antibiotikaresistenz identifizieren und validieren, z.B. bei E. coli und P. aeruginosa.
Pangenomweite Vorhersage der Genfunktion
Dank Hochdurchsatz-Sequenzierung lassen sich Genomsequenzen Hunderter Bakterienstämme effizient analysieren, wodurch Unterschiede von bis zu 60 % im Gengehalt, wie bei E. coli, erkennbar sind. Mithilfe maschinellen Lernens wollen wir Funktionen akzessorischer Gene besser vorhersagen und deren Beitrag zum Überleben in spezialisierten Nischen entschlüsseln.
