Marco Galardini

Prof. Dr. Marco Galardini

Forschungsgruppenleiter
Kontakt
(0)511-220027-208marco.galardini@twincore.de

Über

Marco Galardini ist Bioinformatiker mit einer Vorliebe für Mikrobiologie. Er absolvierte sein Bachelor- und Masterstudium in Italien an den Universitäten von Florenz und Bologna und promovierte im Labor von Marco Bazzicalupo. Anschließend absolvierte er zwei Postdocs: einen im Labor von Pedro Beltrao am EMBL-EBI und einen im Labor von Mo Khalil an der Boston University. Seit Oktober 2020 leitet er das Microbial Pangenomes Lab am TWINCORE.
Sein derzeitiger Schwerpunkt liegt auf der Entwicklung von Berechnungsmethoden zur Untersuchung der genetischen Determinanten von bakterieller Virulenz und antimikrobieller Resistenz sowie auf der empirischen Untersuchung der Resistenzentwicklung. Seine Professur in Hannover wird durch den Exzellenzcluster RESIST finanziert.

 

Projekte

AG Galardini
Bakteriologie

Prüfung der Auswirkungen des genetischen Hintergrunds auf die antimikrobielle Resistenz

Populationsgenetische Studien zeigen, dass genetische Variabilität zwischen Bakterienstämmen die Entwicklung antimikrobieller Resistenzen beeinflussen kann. Durch den Einsatz der automatisierten Laborevolution (ALE) untersuchen wir, wie genetische Hintergründe die AMR-Evolution steuern.

AG Galardini
Bakteriologie

Untersuchungen von Genotyp zu Phänotyp bei Bakterien

Durch die Anwendung statistischer Genetikmethoden auf Erregergenomsequenzen wollen wir genetische Determinanten von Phänotypen wie Pathogenität, Virulenz und Antibiotikaresistenz identifizieren und validieren, z.B. bei E. coli und P. aeruginosa.

AG Galardini
Bakteriologie

Pangenomweite Vorhersage der Genfunktion

Dank Hochdurchsatz-Sequenzierung lassen sich Genomsequenzen Hunderter Bakterienstämme effizient analysieren, wodurch Unterschiede von bis zu 60 % im Gengehalt, wie bei E. coli, erkennbar sind. Mithilfe maschinellen Lernens wollen wir Funktionen akzessorischer Gene besser vorhersagen und deren Beitrag zum Überleben in spezialisierten Nischen entschlüsseln.

Publikationen

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