Über dieses Projekt

Ein Hauptziel unseres von der Helmholtz-Gemeinschaft geförderten Projekts im CoViPa-Konsortium ist es, die Pandemievorsorge durch computergestützte Hochdurchsatz-Virusentdeckung und evolutionäre Analysen zu verbessern, um sowohl RNA-Viren mit einem hohen Risiko des Übergreifens auf die menschliche Bevölkerung als auch potenzielle tierische Wirtsreservoirs zu identifizieren. Wir nutzen >149.000 RNA-Virus-Sequenzen, die wir bei unserem SRA-Screening von >500.000 eukaryotischen Transkriptomprojekten entdeckt haben, um die Koevolution von Virus und Wirt zu untersuchen und Viren mit einem breiten Wirtsspektrum zu identifizieren, von denen wir annehmen, dass sie die höchste Wahrscheinlichkeit für ein Spillover aufweisen. Darüber hinaus wenden wir computergestützte Ansätze an, um die funktionelle Charakterisierung des Proteoms von Corona- und anderen Nidoviren voranzutreiben, um mögliche unbekannte Pathogenitätsfaktoren dieser Viren zu identifizieren. Mittelfristig planen wir, potenziell neue virale Pathogenitätsfaktoren, die durch die bioinformatische Analyse vorhergesagt wurden, durch Expressionstests und funktionelle Phänotypisierung experimentell zu charakterisieren, um zum Beispiel Inhibitoren der Interferon-Signalübertragung in Zusammenarbeit mit anderen RESIST- und CoViPa-Mitgliedern aufzudecken.

Finanzierung

KA1-Co-02 CoViPa

Projektbeteiligte

Prof. Chris Lauber