Über dieses Projekt

Wir haben auf Hochleistungsrechnern basierende Analyseabläufe entwickelt, die es uns ermöglichen, unbearbeitete NGS-Daten aus dem Sequence Read Archive (SRA) effizient und sensitiv auf das Vorhandensein von Viren zu untersuchen, die möglicherweise als Nebenprodukt der Sequenzierung des Wirtsgenoms oder Transkriptoms mitsequenziert wurden. Wir haben ein besonderes Interesse an der Entdeckung hochgradig divergenter neuer Viren. Wir wollen das menschliche Virom als potenziellen Faktor für die Anfälligkeit für Infektionen sowie als mögliche Ursache für andere Krankheiten wie primäre Immundefekte, Krebs und Lebererkrankungen erforschen. So sind wir im DZIF involviert, um nach Assoziationen von Viren mit kryptischer Hepatitis zu suchen. Wir wollen interindividuelle Unterschiede in der Zusammensetzung des Viroms zwischen kranken und gesunden Personen untersuchen. Darüber hinaus weiten wir unseren Ansatz zur Entdeckung von Viren auf Viren in Tieren und anderen Eukaryonten aus, um (i) Säugetierarten zu identifizieren, die unbekannte Verwandte humanpathogener Viren beherbergen, was die Grundlage für die Entwicklung neuer Tierinfektionsmodelle bilden könnte, und (ii) eine umfassende Beschreibung der Virus-Wirt-Koevolution von RNA-Viren bei Eukaryonten zu erlangen.

Finanzierung

EXC 2155: RESIST, KA1-Co-02 CoViPa

Project Participants

Prof. Chris Lauber